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复旦大学基础医学院医学系统生物学系成立

2019-09-13 14:45

日前,《科研论文的构思,撰写和发表》课程第四讲在F2201教室举行。复旦大学生物医学研究院常务副院长、九七三项目首席科学家杨芃原教授,以《大数据时代的生物医学研究》为题,为同学们讲解当今信息化技术的飞跃发展对生物医学事业的巨大推动,帮助大家答疑解惑。偌大的教室座无虚席,同学们纷纷提前在教室做好准备,等待着杨教授的到来。

2015年1月21日下午14:00,复旦大学基础医学院医学系统生物学系成立揭牌仪式在枫林校区明道楼二楼多功能厅隆重举行。上海医学院副院长包志宏、生物医学研究院院长杨芃原、党委书记储以微、基础医学院院长汤其群、党委书记袁继鼎、副院长钱睿哲、姜宴、基础医学院系主任代表以及医学系统生物学系教职工等出席仪式。会议还荣幸的邀请到中科院北京基因组研究所、华大基因研究中心刘斯奇研究员,中科院上海生科院生化细胞所雷鸣研究员,中科院上海生科院计算生物学研究所韩敬东研究员,中科院上海药物所左建平研究员。揭牌仪式由基础医学院党委书记袁继鼎主持。

2018年6月8日下午1点30分,应南京师范大学南瑞电气与自动化学院邀请,英国Sussex大学杨泰澄教授在我校紫金校区一教328会议室做了一场题为“虚拟参考反馈整定及人工智能的工程应用”的精彩学术讲座。

杨芃原教授结合自己的科研经历,为同学们科普了生物大数据的定义和重要性,随后从各个主题谈起,为同学们细心讲解了生物大数据在生命科学研究中的重要作用。杨教授强调,生物大数据在近几年中发展迅速,其中蛋白质组和基因组大数据的发展最为迅猛。目前生物大数据的目标与任务是满足医学的需求,实现以生物标志物为主的早期诊断,预后预测和个性化治疗。这场令人耳目一新的课程,启迪同学们在日后的学习和科研工作中,要重视创新思维的构建,重视生物医学前沿内容的探索,重视科研与解决临床问题的结合,“研有所用”,这才是每个科研人毕生的追求。

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杨泰澄博士1990年在英国曼彻斯特大学获得博士学位,现为英国Sussex大学工程与信息学院reader。2017年受聘为南京师范大学讲座教授,多年来一直从事网络控制、电力系统、新能源以及分布式控制等方面的研究,已发表150余篇论文,还主持开发了网络控制仿真软件包NCS_simu,适用于网络统计特性已知情况下的网络控制性能分析和研究,多次在国际会议上做大会报告。曾主持美国航空航天局以及英国电力局的多个科研项目。

在课程过程中,杨教授与台下学生始终保持着亲密的互动。他多次走下讲台,当场提问,与同学们面对面的讨论,耐心地为同学们解决在大数据及医学系统生物学学习及应用时的困惑,加深了同学们对课程内容的理解。教室里时不时响起掌声,同学们纷纷表示受益匪浅。在课程结束时,热烈的掌声再次响起,感谢杨教授带来的精彩演讲。

生物医学研究院院长、医学系统生物学系主任杨芃原教授首先致辞。杨教授指出基础医学院与生物医学研究院长期以来密切合作,随着交叉学科建设的不断深入,建立医学系统生物学系是双方在合作过程中水到渠成的必然成果,也是学科建设的重要里程碑。杨教授指出,希望医学系统生物学系的建设和发展能够为复旦大学新一轮的建设世界一流大学的事业贡献绵薄之力。

杨教授本次学术报告会高度强调面对智能化的快速发展,如何“站在巨人的肩膀上”开发大数据,并且在软硬件的学习和使用方面给学生做了示范,开阔了同学们视野、提高了同学们的学术技能,更为大家提供了今后科研的航向标。

基础医学院院长汤其群在讲话中表示,医学系统生物学系作为基础医学的重要二级学科登上基础医学的发展舞台,顺应了交叉学科开拓创新的发展趋势,尤其在转化医学、重要疾病发病研究等领域必将带来长足的发展,期望医学系统生物学系扎实推进学科建设,不仅服务于学校、服务于上海,更为全国医科的发展做出贡献。

报告的第一部分杨教授对TensorFlow进行了详细的介绍以及针对如何使用做了详细的示范,然后以斯坦福大学TensorFlow的课程为例,给大家讲述了如何利用已有的资源对其更好的学习;在第二部分,杨教授在报告中指出目前Python语言是当下热门的计算机语言,只有打好基本的语言学习的基础,才能很好地利用API结合Python和TensorFlow,从而利用High Performance Computing对大数据进行分析,实现真正地软硬件结合;第三部分,杨教授向大家展示了以区分图像颜色为例的大数据的动态分析,使同学们有了直观的、具体的案例进行学习;第四部分,杨教授就Coursera网站和针对如何检索未发表、未接收的文献检索进行演示,指导同学们如何更好地利用共享资源

随后,上海医学院副院长包志宏、基础医学院院长汤其群、党委书记袁继鼎、生物医学研究院院长杨芃原共同为医学系统生物学系揭牌。

讲座最后,杨教授跟与会同学就报告内容展开深入交流,针对同学和老师提出的问题,就“机器学习在控制方面的应用”、“人工智能的推广可行性”、“如何入门深度学习的知识”这三个方面提供了详细、深刻地解答,大家深深被杨教授认真、严谨、负责的科研态度和治学精神所感染,本次学术交流会在大家热烈的掌声中圆满结束!

揭牌仪式后,刘斯奇研究员、雷鸣研究员、韩敬东研究员、左建平研究员分别从蛋白质组学、结构生物学、生物信息学、小分子药物设计等方向为参会师生带来精彩的学术报告。

南瑞与电气自动化学院

江苏省三维打印重点实验室供稿

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